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Peter est résolu à quitter l'univers dans lequel il se trouve pour retrouver le sien. Cependant, Walter, le seul être qui puisse l'aider, refuse. Peter a donc l'idée d'aller dans l'autre univers pour demander de l'aide à Walternate. Olivia accepte de l'aider, à condition que Lincoln Lee l'accompagne. Ils réutilisent la machine conçue par Walter pour traverser les dimensions à l'opéra Orpheum, avant de partir pour la Statue de la Liberté, vers Walternate.
Une fois passés de l'autre côté, Lee et Peter sont vite détectés par la division Fringe, qui a une autre affaire étrange à gérer : un métamorphe a été tué près d'une gare, mais le corps a rapidement été envoyé au ministère de la Défense sur ordre de Walternate, laissant les Lee et Olivia de cet univers dans le flou. Lee et Peter se font capturer alors qu'ils étaient sur le point de partir pour Liberty Island. Pendant le transfert, le chauffeur du van où se trouvent les prisonniers reçoit un appel, détourne le véhicule, tue son partenaire avant de libérer Lee et Peter pour les tuer. Ceux-ci parviennent à se défendre et Lee couvre la fuite de Peter, qui rejoint le domicile de Walternate. Là, il rencontre la femme de Walternate, qui reconnait en Peter son fils défunt et accepte de l'amener à Walternate. Lee, quant à lui, est interrogé par Faux-livia et son coéquipier, et s'interrogent eux aussi sur l'origine de cet appel et des métamorphes. À Liberty Island, Walternate et Peter échangent rapidement leurs points de vue, mais Walternate veut transmettre un message à l'autre dimension. En effet, il veut que Peter leur dise qu'il n'est pas le concepteur des métamorphes, et le prouve en tuant son assistant, le Dr Fayette, en réalité un métamorphe. Walternate est persuadé qu'il existe d'autres métamorphes, infiltrés dans le gouvernement, mais qu'il n'est pas le responsable et que la seule personne qui puisse transmettre le message de bonne foi est Peter, le seul être désintéressé par le conflit entre les deux mondes. Quand Fauxlivia et Lee en viennent à la même conclusion et demandent la permission d'enquêter à Broyles, celui-ci accepte avant d'en informer le concepteur des métamorphes, David Robert Jones. Dans l'univers original, Olivia attend le retour de Lee mais rencontre l'Observateur, blessé, qui lui révèle qu'elle devra bientôt mourir.